Набор реагентов«ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2»


Производитель: НПФ Синтол
Регистрационное удостоверение: есть

Набор реагентов «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2» предназначен для качественного определения РНК коронавируса SARS-CoV-2 с помощью полимеразной цепной реакции в реальном времени с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР-РВ) и флуоресцентной детекцией в препаратах НК, выделенных из проб, полученных при взятии мазков со слизистой носо- и ротоглотки, мокроты, промывных вод бронхов, полученных при фибробронхоскопии (бронхоальвеолярный лаваж).

Описание:

Диагностическая роль набора реагентов заключается в возможности его использования для этиологической диагностики тяжелой острой респираторной инфекции – COVID-19 с помощью МАНК при исследовании материала от больного (подозрительного на заболевание).

Особенности и возможности:

  • Обратная транскрипция и ПЦР-РВ – в одной пробирке

Обнаружение фрагментов нуклеиновых кислот коронавируса SARS-CoV-2 реализовано методом обратной транскрипции, совмещенной с полимеразной цепной реакцией в реальном времени (ОТ-ПЦР-РВ) в одной микропробирке, что позволяет уменьшить количество манипуляций с реакционной смесью и тем самым максимально снизить количество ошибок и возможность контаминации при постановке ОТ-ПЦР-РВ.

  • Наличие различных форматовдля удобства пользователей:
    -нераскапанный формат;
    -готовая к использованию лиофилизованная реакционная смесь, расфасованная в стрипованные ПЦР-пробирки (жёсткие или гибкие) или ПЦР-плашки.

Лиофилизированный формат позволяет транспортировать наборы реагентов при комнатной температуре (без соблюдения «холодовой цепи») и хранить их при температуре от плюс 2°С до плюс 8°С.

  • Анализ по двум генам и двойной контроль

Набор реагентов использует преимущества мультиплексной ОТ-ПЦР-РВ, а именно: одновременное выявление в одной пробе двух фрагментов РНК коронавируса SARS-CoV-2 (гены orf1ab и N), а также двух контрольных реакций Внутреннего Положительного Контроля по разным каналам детекции флуоресценции.

Выявление РНК SARS-CoV-2 по двум специфическим фрагментам (каналы детекции R6G и ROX) позволяет обеспечить достоверную и надежную диагностику любых штаммов SARS-CoV-2, в том числе новых вариантов: британского – Alpha (B.1.1.7); южноафриканского – Beta (B.1.351); бразильского – Gamma (Р.1); индийского – Delta (B.1.617.2) и др.

Наличие двух контрольных реакций Внутреннего Положительного Контроля позволяет оценить:
— эффективность выделения нуклеиновых кислот (канал детекции FAM);
— степень ингибирования реакции обратной транскрипции и амплификации (канал детекции Cy5);
— исключить ложноотрицательные результаты анализа.

Комплект поставки:

Набор реагентов«ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2»выпускается в 4 формах:

  • Форма выпуска 1включает комплект реагентов для выделения РНК ручным способом и на автоматизированных станциях KingFisher Flex System «М-Сорб-НК», комплект реагентов для проведения ОТ-ПЦР-РВ анализа «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2».
  • Форма выпуска 2включает комплект реагентов для выделения РНК ручным способом и на автоматизированных станциях KingFisher Flex System «М-Сорб-НК», комплект реагентов для проведения ОТ-ПЦР-РВ анализа «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2-Л».
  • Форма выпуска 3включает комплект реагентов для проведения ОТ-ПЦР-РВ анализа «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2».
  • Форма выпуска 4включает комплект реагентов для проведения ОТ-ПЦР-РВ анализа «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2-Л».

Формы выпуска 1 и 2 предназначены для проведения полного ПЦР-исследования, включающего экстракцию РНК из клинического материала методом сорбции на магнитных частицах и амплификацию РНК методом обратной транскрипции, совмещенной с полимеразной цепной реакцией в реальном времени (ОТ-ПЦР-РВ).

Формы выпуска 3 и 4 предназначены для проведения амплификации РНК методом обратной транскрипции, совмещенной с полимеразной цепной реакцией в реальном времени (ОТ-ПЦР-РВ). Для проведения полного ПЦР-исследования с использованием форм выпуска 3 и 4 необходимо использовать комплект реагентов для экстракции РНК (например, «РИБО-преп», ФСР 2008/03147).

Технические характеристики:

  • Чувствительность – не более1,0х103 копий РНК в миллилитре пробы (копий·мл-1) с воспроизводимостью не менее 97 %.
  • Специфичность – ложноположительные результаты при анализе образцов НК респираторных инфекций: вирусы тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV), ближневосточного респираторного синдрома (MERS-CoV), гриппа типа А (H1N1, H3N2, H7N9, H5N1) и В, респираторно-синцитиальный вирус (РСВ), аденовирус 5 типа человека, риновирус человека, метапневмовирус человека, коронавирус человека, вирус парагриппа 1 типа, респираторный вирус человека,Streptococcus pneumoniaeHaemophilus influenzae type B, отсутствовали
  • Ингибирующего влияния эндогенных (гемоглобин 200 мкг/мл, муцин 5%) и экзогенных (Хлоргексидин 0,5%, Стоматофит 1,5%, Мирамистин 0,001%, раствор Люголя с глицерином 0,5%) потенциально интерферирующих веществ на результат ОТ-ПЦР при исследовании образцов набором «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2» не обнаружено.
  • Постановка ОТ-ПЦР-РВ осуществляется на приборах для ПЦР-РВ, зарегистрированных в РФ как медицинское изделие и имеющих каналы детекции, соответствующие красителям FAM, R6G, ROX, Cy5 (либо их спектральным аналогам) – «АНК-32»/«АНК-М» (ИАП РАН, г. Санкт-Петербург), «CFX-96» (BioRad, США), «RotorGene» (Qiagen, Германия), «DTprime» («ДНК-Технология», Россия), «QuantStudio» (ThermoFisher Scientific, США).
  • Эффективность выделения РНК ручным или автоматическим методом одинаковая; эффективность выявления вируса в вариантах исполнения лиофилизированной или жидкой реакционной смеси одинаковая.
Диагностическая специфичность (доля негативных результатов теста в группе отрицательных образцов) Интервал диагностической специфичности (с доверительной вероятностью 95%)* Диагностическая чувствительность (доля позитивных результатов теста в группе положительных образцов) Интервал диагностической чувствительности (с доверительной вероятностью 95%)**
100 % 96,97-100.00 % 100 % 96,23% -100.00 %

* – при исследовании 120 заведомо отрицательных образцов клинического материала определяемый по методу Клоппера и Пирсона

** – при исследовании 96 заведомо положительных образцов клинического материала определяемый по методу Клоппера и Пирсона